小熊貓（Ailurus fulgens）隸屬于食肉目鼬超科小熊貓科。然而，長(zhǎng)期以來(lái)，關(guān)于小熊貓亞種或物種的劃分存在爭(zhēng)議，一方面是傳統(tǒng)的形態(tài)劃分特征在地理分布上不完全一致，另一方面一直缺乏遺傳學(xué)證據(jù)的支持。關(guān)于小熊貓亞種或物種從古至今的演化歷史尚不清楚。
近日，第二次青藏高原綜合科學(xué)考察研究有了重要發(fā)現(xiàn)。該研究全面提供了小熊貓兩個(gè)物種分化的遺傳學(xué)證據(jù)，厘清了長(zhǎng)期存在的亞種或物種劃分的爭(zhēng)議；并在基因組水平深入揭示了小熊貓屬兩個(gè)物種的演化歷史與瀕危過(guò)程，為合理保護(hù)對(duì)策的制定提供了科學(xué)依據(jù)。相關(guān)研究結(jié)果在線發(fā)表于2月27日的《科學(xué)進(jìn)展》雜志上。
據(jù)了解，小熊貓目前僅分布在喜馬拉—橫斷山脈區(qū)域，包括中國(guó)、緬甸、不丹、印度及尼泊爾等國(guó)家，屬于青藏高原旗艦物種。1902年以來(lái)，小熊貓被分為兩個(gè)亞種：喜馬拉雅亞種（A。 f。 fulgens）和中華亞種（A。 f。 styani），并將怒江作為亞種分化的地理邊界；近期也有分類學(xué)家根據(jù)形態(tài)差異和地理分布，將這兩個(gè)亞種提升為物種，即喜馬拉雅小熊貓（A。 fulgens）和中華小熊貓（A。 styani）。
高原動(dòng)物多樣性保護(hù)和可持續(xù)利用專題研究團(tuán)隊(duì)利用種群基因組學(xué)方法，對(duì)來(lái)自7個(gè)地理種群的65只野生小熊貓進(jìn)行全基因組重測(cè)序分析，組裝了49只小熊貓的線粒體基因組，并對(duì)49只雄性小熊貓進(jìn)行Y染色體SNP變異分型。
上述3種標(biāo)記的分析結(jié)果均發(fā)現(xiàn)，兩個(gè)區(qū)域的小熊貓存在顯著的遺傳分歧，且線粒體基因組單倍型和Y染色體SNP單倍型均無(wú)共享，這些結(jié)果顯著支持將小熊貓劃分為兩個(gè)系統(tǒng)發(fā)生種（phylogeneticspecies），即喜馬拉雅小熊貓（A。 fulgens）和中華小熊貓（A。 styani）。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)，雅魯藏布江最可能是兩個(gè)物種分化的地理邊界，而不是傳統(tǒng)認(rèn)為的怒江，這也解釋了之前發(fā)現(xiàn)的“傳統(tǒng)的形態(tài)劃分特征在地理分布上不完全一致”現(xiàn)象。
基于基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)，重構(gòu)了兩種小熊貓的種群波動(dòng)和分歧歷史，發(fā)現(xiàn)其具有明顯不同的演化歷史，其中中華小熊貓經(jīng)歷了2次種群瓶頸和1次明顯的種群擴(kuò)張，而喜馬拉雅小熊貓則經(jīng)歷了3次種群瓶頸和1次很小的種群擴(kuò)張。兩個(gè)物種是在更新世倒數(shù)第二個(gè)冰期遭遇嚴(yán)重種群瓶頸后，開始發(fā)生分化；之后東喜馬拉雅-高黎貢遺傳種群分化出來(lái)，最后四川邛崍遺傳種群同小相嶺-涼山遺傳種群發(fā)生分化。
進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)，喜馬拉雅小熊貓具有最低的遺傳多樣性，最高的連鎖不平衡及較高的有害遺傳變異負(fù)荷，凸顯了急需加強(qiáng)喜馬拉雅小熊貓保護(hù)的緊迫性。另外，該研究結(jié)果為科學(xué)保護(hù)兩種野生小熊貓、建立準(zhǔn)確的圈養(yǎng)小熊貓譜系及避免種間雜交提供了科學(xué)依據(jù)。
高原動(dòng)物多樣性保護(hù)和可持續(xù)利用專題研究員胡義波、中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物所博士生Arjun Thapa為論文的共同第一作者，魏輔文院士為論文的通訊作者。該研究得到了中國(guó)科學(xué)院、國(guó)家自然科學(xué)基金委、生態(tài)環(huán)境部、第二次青藏高原綜合科學(xué)考察研究項(xiàng)目的資助。
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