自3月初上線針對新冠病毒的研究后,世界上最大的分布式計算項目Folding@home(簡稱“FAH”)就受到了全世界的矚目。
根據(jù)FAH新冠病毒項目負(fù)責(zé)人格雷格·鮑曼(Greg Bowman)的最新推特,截至目前,全球有100萬的用戶志愿貢獻(xiàn)自己的算力,一起抗擊新冠疫情。其中包括英偉達(dá)40萬游戲玩家和8萬AMD用戶貢獻(xiàn)的GPU資源。

Folding@home成立于2000年10月1日,是一個研究蛋白質(zhì)折疊、誤折、聚合及由此引起的相關(guān)疾病的分布式計算工程。3月初,F(xiàn)AH發(fā)起新冠病毒研究項目,希望能利用志愿者閑置的中央處理器來構(gòu)建計算能力。要參加新冠病毒項目,志愿者可以下載FAH軟件,將自己計算機(jī)資源將發(fā)送到Folding@home。
隨后,包括英偉達(dá)在內(nèi)的公司呼吁公眾將其多余的計算能力捐贈給該項目,該項目因此吸引了更多的志愿者。
眾多志愿者的加入,也讓FAH項目迎來一個里程碑。上周,F(xiàn)olding@home表示,自己的算力突破百億億次。相比之下,美國橡樹嶺國際實驗室的超級計算機(jī)“頂點”的算力是每秒14.86億億次。
鮑曼在一封電子郵件中說:“我們還對服務(wù)器端基礎(chǔ)架構(gòu)進(jìn)行了許多改進(jìn),大多數(shù)計算資源將用于冠狀病毒?!?/p>
COVID-19 相關(guān)的蛋白質(zhì)示例 圖片來自Folding@home官網(wǎng)
Folding@home一直在嘗試通過模擬冠狀病毒的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)在微觀水平上折疊和展開的方式來開發(fā)這種大流行的治療方法。FAH在其官網(wǎng)上表示,2019-nCoV是SARS冠狀病毒(SARS-CoV)的“近親”,并且以類似的方式起作用。對于兩種冠狀病毒,當(dāng)病毒表面的蛋白質(zhì)與肺細(xì)胞上的受體蛋白質(zhì)結(jié)合時,肺部感染就發(fā)生了。這種病毒蛋白稱為刺突蛋白。由于蛋白質(zhì)不會停滯,會擺動,折疊和以多種形狀展開呈現(xiàn),所以我們不僅需要研究病毒刺突蛋白的一種形狀,還需要研究該蛋白擺動、折疊成其他形狀的所有方式,以便更好地了解其與ACE2受體是如何相互作用的,從而可以開發(fā)出治療抗體。了解這些信息,需要我們對2019-nCoV峰值蛋白的結(jié)構(gòu)進(jìn)行建模。
此前Folding@home研究的項目還包括阿爾茲海默病、亨廷頓舞蹈癥、牛海綿狀腦病(瘋牛?。┌Y和囊胞性纖維癥。
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