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管軼新論文:穿山甲中發(fā)現(xiàn)冠狀病毒 與新冠9成相

時(shí)間:2020-02-21 14:40來源:網(wǎng)絡(luò)整理 瀏覽:
基因組測序顯示,這些在穿山甲身上新發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒與感染人的新冠病毒有大約85.5%至92.4%的相似性,分屬2019-nCoV相關(guān)冠狀病毒的


基因組測序顯示,這些在穿山甲身上新發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒與感染人的新冠病毒有大約85.5%至92.4%的相似性,分屬2019-nCoV相關(guān)冠狀病毒的兩個(gè)子譜系。

新京報(bào)快訊(記者 李玉坤)醫(yī)學(xué)論文預(yù)印本網(wǎng)站bioRxiv2月18日發(fā)表了香港大學(xué)醫(yī)學(xué)院教授管軼、廣西醫(yī)科大學(xué)胡艷玲等人論文,論文提到,在廣東、廣西截獲的從東南亞走私來的穿山甲中,發(fā)現(xiàn)了冠狀病毒,并且與新冠病毒(2019-nCoV)的相似度在85.5%到92.4%之間。

這篇名為Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in southern China(華南地區(qū)馬來亞穿山甲中2019-nCoV相關(guān)冠狀病毒的鑒定)的論文認(rèn)為,盡管蝙蝠可能是2019-nCoV的原始宿主,但尚不清楚任何有助于轉(zhuǎn)移給人類的中間宿主的身份。

論文報(bào)告了中國華南地區(qū)在反走私行動中查獲的穿山甲中2019-nCoV相關(guān)冠狀病毒的鑒定?;蚪M測序顯示,這些在穿山甲身上新發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒與感染人的新冠病毒有大約85.5%至92.4%的相似性,分屬2019-nCoV相關(guān)冠狀病毒的兩個(gè)子譜系。

華南市場被清理增加宿主動物尋找難度

論文提到,許多早期病例與湖北省武漢市的華南海鮮市場有關(guān),推測可能是這次人畜共患病新冠肺炎的來源。目前,中國疾病預(yù)防控制中心僅報(bào)告了從市場上獲取的環(huán)境樣品2019-nCoV呈陽性。但是,由于類似的生鮮市場(wet market)已經(jīng)被證明了與2002-2003年的SARS暴發(fā)有關(guān),因此野生動物似乎也可能參與了2019-nCoV的出現(xiàn)。

暴發(fā)前,華南海鮮市場上有許多非水生哺乳動物可供購買。不幸的是,由于市場在疫情暴發(fā)后不久就被清理了,因此從市場確定野生動物中的源病毒具有挑戰(zhàn)性。盡管現(xiàn)已鑒定出2013年從云南菊頭蝙蝠中取樣的冠狀病毒與2019-nCoV密切相關(guān),但尚未在其他野生動物物種中檢測到緊密相關(guān)的病毒。

論文認(rèn)為,穿山甲發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒的多個(gè)譜系與2019-nCoV極其相似,穿山甲應(yīng)被視為新冠病毒可能的中間宿主,應(yīng)嚴(yán)禁在生鮮市場中出售,以防止人畜共患病傳播。

廣西、廣東查獲的穿山甲都帶有冠狀病毒

研究人員調(diào)查了穿山甲的病毒組成。他們表示,這種動物是哺乳動物中最不合法販運(yùn)的動物:它們既被用作食物來源,其鱗片也被用作傳統(tǒng)中藥。在世界自然保護(hù)聯(lián)盟瀕危物種紅色名錄中,許多穿山甲種類被視為極度瀕危。

論文研究者收到了從18只馬來亞穿山甲收集的冷凍組織(肺、腸、血液)樣品,這些穿山甲是2017年8月至2018年1月廣西海關(guān)在反走私行動中獲得的。這些組織中RNA的高通量測序顯示,43個(gè)樣本中的6個(gè)(兩個(gè)肺、兩個(gè)腸、一個(gè)肺腸混合物、一個(gè)血液)中存在冠狀病毒。研究者對2018年5月至7月之間收集的另一批穿山甲樣品進(jìn)行了進(jìn)一步的qPCR測試,12只動物中的19個(gè)樣本(9個(gè)腸組織、10個(gè)肺組織)中,有3個(gè)肺組織樣本呈冠狀病毒陽性。

除了來自廣西的動物外,在新冠疫情暴發(fā)后,廣州海關(guān)技術(shù)中心重新檢查了他們在以前的反走私活動中獲得的5份存檔的穿山甲樣品(兩張皮膚拭子、一個(gè)未知組織、一個(gè)鱗片)。經(jīng)過高通量測序后,鱗片樣本被發(fā)現(xiàn)含有冠狀病毒讀段,與2019-nCoV基因組相似度72%。實(shí)際上,鱗片上的病毒序列可能來自其他受感染穿山甲組織。另外,2019年廣東患病穿山甲肺樣本中檢測出的病毒群也與2019-nCoV有關(guān)。

論文表示,這些穿山甲冠狀病毒基因組與新冠病毒有85.5%至92.4%的相似性,在系統(tǒng)樹中可以表示為2019-nCoV的兩個(gè)亞系。


觀測到了冠狀病毒重組的信號

先前已經(jīng)注意到,β冠狀病毒屬的sarbecovirus亞型的成員經(jīng)歷了廣泛的重組。重組分析顯示,蝙蝠中發(fā)現(xiàn)的兩個(gè)冠狀病毒毒株可能是重組體,包含來自多個(gè)SARS病毒相關(guān)譜系和新冠病毒相關(guān)譜系(包括從穿山甲中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒的譜系)的基因組片段。

更值得注意的是在穿山甲中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒和在蝙蝠中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒,以及人類新冠病毒之間觀察到了重組信號。受體結(jié)合域方面,新冠病毒與廣東穿山甲中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒表現(xiàn)出非常高的序列相似性。

迄今為止,穿山甲是除蝙蝠以外唯一被2019-nCoV相關(guān)冠狀病毒感染的哺乳動物。在穿山甲中發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)相關(guān)的冠狀譜系,它們都與2019-nCoV相關(guān)。這表明這種動物可能是這些病毒的長期宿主。

穿山甲是相對較小種群數(shù)量的動物,狀態(tài)瀕危,但不能排除穿山甲是從蝙蝠或其他動物宿主中獨(dú)立獲得2019-nCoV相關(guān)病毒。值得注意的是,這些病毒可能從來自東南亞的被販運(yùn)的馬來亞穿山甲中獲得,人們對這種動物在其本土地區(qū)所攜帶的病毒多樣性認(rèn)識十分缺乏。

論文表示,穿山甲群中病毒傳播的程度尚需進(jìn)一步調(diào)查,但廣西和廣東在穿山甲中反復(fù)檢測出2019-nCoV相關(guān)冠狀病毒表明,穿山甲可能是新型冠狀病毒的潛在重要宿主。冠狀病毒,包括與2019-nCoV相關(guān)的冠狀病毒,顯然存在于亞洲的許多野生哺乳動物中。盡管穿山甲中冠狀病毒的流行病學(xué)、致病性、種間傳染性和可傳播性尚待研究,但處理這些動物需要相當(dāng)謹(jǐn)慎,應(yīng)嚴(yán)格禁止在生鮮市場中出售它們。為了了解穿山甲在新冠病毒出現(xiàn)中的作用以及未來人畜共患病傳播的風(fēng)險(xiǎn),顯然需要對中國和東南亞自然環(huán)境中的穿山甲進(jìn)行進(jìn)一步監(jiān)測。

追問1

論文中的這幾批穿山甲哪里來的?

論文提出,廣西和廣東檢測的幾批馬來亞穿山甲,可能都是來自東南亞走私。

近年來,廣東、廣西海關(guān)多次查獲從東南亞走私的穿山甲及其鱗片。2016年5月,東興海關(guān)破獲一起重大涉嫌走私穿山甲案,查獲走私入境的國家二級保護(hù)動物活體穿山甲15只。2018年,廣西東興海關(guān)共查獲走私穿山甲活體90只,還查獲了200公斤穿山甲鱗片。

2017年8月17日,欽州海警向廣西自治區(qū)林業(yè)廳移交其查獲的走私入境馬來亞穿山甲34只,其中32只活體,2只死體。廣西陸生野生動物救護(hù)研究與疫源疫病監(jiān)測防控中心(簡稱“廣西野生動物救護(hù)中心”)接收了這批穿山甲,2個(gè)月后陸續(xù)發(fā)病和衰竭死亡。

2019年3月23日,海關(guān)總署緝私局統(tǒng)一部署和廣東分署緝私局直接指揮開展的“守護(hù)者2019”打擊瀕危物種走私專項(xiàng)行動,查獲103只活體穿山甲,其中68只活體被送往廣西野生動物救護(hù)中心進(jìn)行緊急搶救。中國生物多樣性保護(hù)與綠色發(fā)展基金會(簡稱 綠發(fā)會)志愿者參與了這批穿山甲的救治。記者從綠發(fā)會了解到,送往廣西野生動物救護(hù)中心的68只穿山甲,截至2019年4月11日存活36只。送往廣東野生動物救護(hù)中心的穿山甲截止到2019年5月23日,存活3只。

追問2

這些穿山甲當(dāng)時(shí)感染什么病毒?

2017年8月,廣西野生動物救護(hù)中心接收34只馬來亞穿山甲,2個(gè)月內(nèi)全部死亡。這件事一度引發(fā)質(zhì)疑。

2018年8月6日,有媒體報(bào)道這批穿山甲凍體仍存放于凍庫中。救護(hù)中心稱,在該批次穿山甲中,有33只穿山甲攜帶高致病病毒。當(dāng)時(shí),中心主任廖河康表示,相關(guān)樣本已由中國軍事科學(xué)院微生物流行病研究所檢測。

綠發(fā)會2月20日告訴記者,他們一直申請公開病毒的名稱,但是從國家林草局2次行政復(fù)議,到東城區(qū)法院、北京二中院,一直到北京高院去年的受理,都沒有公開,“我們補(bǔ)充了2次證據(jù)材料,都沒有回復(fù)”。

近日,廣西野生動物救護(hù)中心就“2017年8·17批次馬來亞穿山甲全部死亡作出回應(yīng)”?;貞?yīng)稱,該批次穿山甲移送到中心進(jìn)行救護(hù)時(shí)已攜帶有疾病,經(jīng)救護(hù)中心采樣送國內(nèi)相關(guān)機(jī)構(gòu)檢測,檢測出感染了犬型細(xì)小病毒,在救護(hù)期間疾病發(fā)作等多種原因?qū)е滤劳?,相關(guān)信息已全部向社會公開,并對檢測機(jī)構(gòu)名稱的失誤做了更正。

廣西野生動物救護(hù)中心同時(shí)表示,基于“8·17”批次34只馬來亞穿山甲全部感染了犬型細(xì)小病毒,并導(dǎo)致全部死亡,從動物疫病防控角度出發(fā),中心將該病毒列為對馬來亞穿山甲產(chǎn)生疾病危害的高致性病毒,屬于動物間高致病性病毒,并不是公眾所理解的導(dǎo)致人獸共患的高致病性病毒。細(xì)小病毒是DNA病毒,屬于細(xì)小病毒科細(xì)小病毒屬的病毒;新型冠狀病毒是RNA病毒,屬于冠狀病毒科冠狀病毒屬的病毒,兩者毫不相干。雖然華南農(nóng)大等單位發(fā)布了穿山甲攜帶的病毒與新型冠狀病毒99%相似,并明確穿山甲是新型冠狀病毒的潛在中間宿主,但并不能說明中心收容救護(hù)的穿山甲就攜帶有新型冠狀病毒,也與救護(hù)中心對“8·17”批次馬來亞穿山甲檢測出高致病性病毒——犬型細(xì)小病毒是完全不同的兩個(gè)結(jié)果,更與當(dāng)前全國暴發(fā)的新型冠狀病毒感染肺炎疫情完全扯不上關(guān)系。

追問3

武漢有沒有出售穿山甲?

目前已知的穿山甲有中華穿山甲、印度穿山甲、馬來亞穿山甲、菲律賓穿山甲、大穿山甲、樹穿山甲、南非穿山甲和長尾穿山甲8個(gè)品種,分布在亞洲和非洲南部的熱帶和亞熱帶地區(qū)。其中,中華穿山甲主要分布在中國長江以南地區(qū)。

但是,2019年6月,綠發(fā)會結(jié)合穿山甲保護(hù)項(xiàng)目合作伙伴、志愿者的紅外相機(jī)野外記錄和走訪情況,近3年內(nèi),僅有效記錄并查證到11只中華穿山甲,且在中國大陸地區(qū)長期未監(jiān)測到中華穿山甲野外種群的存在,宣布中華穿山甲在大陸功能性滅絕。

2018年10月,長江日報(bào)報(bào)道稱,在武漢一只穿山甲因四只腳被“草繩”纏住,困在馬路中間動彈不得。東西湖常青花園派出所110值班民警接警后,立即趕到事發(fā)地點(diǎn)了解情況。民警將縛在穿山甲腳上的草繩解開,隨后,與6村小區(qū)物業(yè)工作人員及陳先生一道,將這只穿山甲送至常青花園社區(qū)附近的林地放生。有人用隨身攜帶的彈簧秤稱了一下,發(fā)現(xiàn)這只穿山甲重約4公斤。

這件事的后續(xù)很有趣,就在綠發(fā)會要到當(dāng)?shù)卣{(diào)查的時(shí)候,當(dāng)?shù)嘏沙鏊饛?fù)稱,他們沒有放生過穿山甲,并強(qiáng)調(diào)如果是穿山甲的話,他們肯定會聯(lián)系森林公安等,不能自己隨意放生。據(jù)派出所民警表示,他們當(dāng)時(shí)放生的是一只刺猬。但是,長江日報(bào)的相關(guān)報(bào)道至今沒有刪除。


這只“穿山甲”被發(fā)現(xiàn)的位置,距離華南海鮮市場三公里左右。

新京報(bào)記者曾在1月下旬探訪武漢華南海鮮市場,一家商鋪的李姓老板告訴記者,市場售賣野生動物的攤位集中在西區(qū)中部一條長廊,“偷著賣那多少是有的”。另有媒體拍到市場西區(qū)六街盡頭遺棄的動物尸體和內(nèi)臟。

講述

“穿山甲女孩”記錄到穿山甲咳嗽、氣喘

2019年3月底,海關(guān)總署緝私局統(tǒng)一部署、廣東分署緝私局直接指揮開展了一次名為“守護(hù)者2019”的打擊瀕危物種走私專項(xiàng)行動,搶救了103只穿山甲活體,其中部分穿山甲被移交至廣東省野生動物救護(hù)中心。

綠發(fā)會工作人員“穿山甲女孩”志愿參與照顧這些穿山甲。

“進(jìn)入去年5月,廣州一連幾天下大雨,穿山甲寄居的籠舍溫度很低,估計(jì)是受涼的原因,剩下的三只穿山甲分別出現(xiàn)流鼻涕、鼻塞、氣喘?!贝┥郊着?月20日告訴記者,專家稱穿山甲的這些感冒癥狀是第一次被人記錄到。

“守護(hù)至5月中旬時(shí),我身上開始奇癢無比,胳膊上、腿上出現(xiàn)成片的紅點(diǎn)?!薄按┥郊着ⅰ闭f,“我每天幾乎24小時(shí)的陪護(hù),可能是被什么蟲子咬了。但我還是堅(jiān)持觀察記錄,給穿山甲拔蜱蟲,為感染眼疾的一只穿山甲滴眼藥、處理尾部化膿。當(dāng)時(shí)的防護(hù)很簡單,就是戴口罩、手套、白大褂,自己并不曾感冒或被病毒感染,現(xiàn)在想想很幸運(yùn)?!?/p>

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